2020年4月30日，北京工商大学第二届党委第151次会议决定设立“北京工商大学系统科学研究院”。研究院立足国际发展前沿和国家发展战略需求，致力于复杂性背景下的系统科学学科建设，围绕北京工商大学商科、轻工和食品优势学科特色，开展复杂系统建模、仿真与调控、系统分析与集成、社会经济系统智能决策与治理、食品安全与应急防控系统等方向的基础理论和应用创新研究，重点解决社会经济、食品、轻工、环境和应急防控等领域中的复杂性、多重性、复合型系统问题。

北京工商大学系统科学研究院的成立符合“习近平总书记提出建设中国新型智库建设，为中国智库发展带来春天”，推进新时代国家高端智库建设的发展趋势。研究院的成立能够发挥北京工商大学多科性大学的人才培养和科学研究优势，提升系统科学作为横断学科的引领作用，并以此更好的推动北京工商大学其他相关优势学科的发展。研究院将依托具有北京工商大学系统科学学科研究方向和支撑平台，培养系统科学和信息科学领域高层次人才，为首都科创战略和高精尖产业发展提供有力的人才、智力和技术支持，努力为国家和京津冀地区系统科学学科建设做出突出贡献。